截至2008年底，国家已累计投入74.79亿元用于塔里木河流域综合治理。自2000年开始，新疆已先后9次向塔里木河下游实施生态输水，总输水量达22.59亿立方米，结束了塔里木河下游河道连续断流30多年的历史，地下水位上升，天然植被得到恢复，目前塔里木河下游植物种类已由输水前的9科3属17种增加到现在的12科26属46种，天然植被恢复面积达180平方公里，植被盖度比输水前最高增长了5倍以上。